Duvida instalar Ubuntu de raiz

[BlinZk]

Boas... cá vai mais uma dúvida.

Tenho dual-boot com WinXP Pro e Ubuntu 8.10
Mas instalei o Ubuntu num disco externo USB (40GB)

Só que, a instalação inicial do Ubuntu, foi a 7.04... daí para a frente, foi só fazer live updates (nunca voltei a instalar de raiz).
Daí que, neste momento tenho o 8.10, mas ele está bastante lento no boot... eu desconfio que deve ter sido das várias instalações e desinstalações, mais alguns erros que eu tenha cometido, inclusive na aventura de instalar o KDE, etc...
Gostava de instalar a 8.10 de raiz, fresquinha e então agora sim com mais calma e cuidado ir só adicionando o que realmente preciso.
A minha pergunta é... consigo instalar de raiz, sem perder aquelas definições do GRUB?
Ou é pacifico eu instalar de raiz e rescrever o GRUB que não arranjo "chatices" com o dual-boot?
Apesar de ter backups, etc... não queria mesmo NADA precisar de formatar o disco onde tenho o XP, ou de perder (mesmo que temporariamente) o acesso a ele.
Quais os melhores procedimentos?

Thanks