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Lápis Azul

Amigos, preciso de ajuda...
Estou com um caso bicudo entre mãos. Passo a explicar:
No PC tenho 2 discos, um de 20GB (do S.O.) e outro de 80 GB. Acontece que, após formatar o disco de 20, ao tentar re-instalar o Win XP, o mesmo bloqueava após a cópia dos ficheiros de instalação. Usando o Norton Partition Magic do Hiren's boot cd (o que uso habitualmente!), tentei formatar ambos os discos e tendo tido sucesso com o de 20 GB, para meu espanto verifiquei que o de 80GB apresentava um tamanho 2TB, ou seja, num disco de 80 estariam 2000GB! No mínimo é bizarro...
Tentei formatar e não conseguia. Usei vários particionadores do Hiren's boot cd e nada. Inclusivé fiz a formatação do MBR e ele de facto apresentava o tamanho correcto mas, voltando à instalação bloqueava novamente e voltavam a verificar-se os tais 2TB de espaço. A única coisa que não fiz, foi o Low Level Format ou o Zero Fill, pois isso demora uma eternidade e não dá garantias de sucesso!
Formatei ambos discos através do MS-Dos, para FAT32 e consegui criar uma partição de 80GB no disco deixando 1920GB não alocado e assim consegui instalar o Win XP (no de 20GB).
Até agora, estou neste momento a instalar o SP3, tudo corre bem sem qualquer erro, contudo, noto um ligeiro atraso no acesso ao disco(de 80GB), isto dentro do Windows Explorer...
Alguém consegue explicar-me isto? E se possivel uma solução?
Mais informo que não está em causa a preservação de dados. Qualquer ferramenta que repare o "erro" é benvinda, nem que seja o interminavel Low Level Format...