Backup Total e Formato de Partições

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Apos uma luta sem igual para meter o Mac OS aqui no PC, finalmente já esta feito, apesar de ainda alguns pormenores técnicos n estarem a 100%.

Anyway, é o seguinte, eu usei 1 disco externo para a instalação do iATKOS L2. Contudo a criação da partição eu coloquei em "Case-sensitive, Journaled". Deparo-me agora com o problema de impossibilidade de instalar o Adobe Reader ou o Photoshop uma vez que eles n são capazes de instalar em partições "Case-sensitive".

Sera possible criar um backup total do SO, formatar o disco em "Journaled" apenas, instalar o SO novamente o iATKOS L2 e dp fazer o restauro do backup feito anteriormente de forma a ficar tudo em ordem again (drivers, configs, software)?

Alguem me pode explicar qual o melhor formato para cada um dos discos?
O que tem o SO, os que vão para armazenamento e por ultimo se tenho um externo em NTFS como posso fazer de forma a o Mac OS poder edita-lo sem ter que modificar o formato do disco?