Gmail no thunderbird

[BAJANKA^^]

Bom dia a minha questão é de rápida e fácil resposta para quem já experimentou, mas preciso de ter a certeza, é o seguinte configurando o gmail no thunderbird com acesso pop3 os emails sao tranferidos para o thunderbird e ficam acessiveis localmente mas e via web no gmail fica tudo igual? (pastas, marcadores, tudo mesmo?)
O que preciso de fazer é transferir tudo para o pc para ter uma cópia dos mails todos, e depois apagar os que acho nao serem precisos para ganhar espaço no gmail. Mas ao fazer esses passos não queria que o pop3 altera-se nada no gmail marcadores etc. Nas opcoes do pop3 no gmail tenho "guarde uma cópia na caixa de entrada", devo ter outra?
Obrigada